Фишка раз - пассивное охлаждение. Покупай видеокарту без кулера, не ставь кулеры на винты, етц.
Фишка два - корпус. Галимые микролабы со звенящими стенками не прокатят, рекомендую какой нибудь CoolerMaster или что то похожее. В низком ценовом диапазоне в кулермастерах не стоят блок питания, его купишь отдельно с небольшим запасом мощности.
Фишка три - охлаждение проца. Нужно какое то охлаждение с регулировкой скорости вращения аля TITAN, IceHammer, etc.
Оперативка, материнская плата, винчестера, процессор не имеют значения для тишины