Перейти к публикации
  • Сейчас на странице   Всего пользователей: 2   (0 пользователей, 2 гостя)

Rooster

Программирование[8]

Рекомендованные сообщения

Парни поясните, я может не совсем правильно понимаю, вобщем суть:

Существуют различные инструменты для поиска структуры белка к примеру, сравнения последовательности ДНК, биологического моделирования ну вы поняли примерно о чем я.

Какой язык надо учить что б создать био модель старения? Читал в одной статье что для этого используют С++ и Python.

Какой язык было бы максимально универсально учить для подобных задач? Вроде моделирования воздействия на клетку, процессов старения, процессов развития age-related diseases(хз как это перевести, возрастных болезней кароче)?Python подойдет?

Если интересна суть то вот статья где поподробнее о таком https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5322748/

Просто хотелось бы хоть какой то практики в этом направлении, а у меня в городе 0 лабораторий в которые можно было бы прийти и поучаствовать в живую в исследовании процессов старения/болезней развивающихся при старении. 

А компьютер есть нормальный вот и подумал что учить какой то язык что б когда то может че то скодить, может и не самое сложное но по теме было бы круто.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

вродь как питон

 

еще есть R чот такое


Скрытый текст

 

OMGVERYLONGNAME написал 08.06.2018 в 12:50:
потому что ты не игрок, ты мразь на любой роли
ZombBomb написал 05.12.2018 в 19:27:
лол
Fint написал 19.07.2019 в 15:49:
Ок, я ошибся

 

 

NaniQue- написал 30.07.2019 в 10:37:
висп вроде норм игрок

 

 

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

а что ты хочешь скодить? 

типа есть какой-то набор параметров клетки, на нее прикладывается какое-то воздействие и они изменяются? да хоть в экселе

типа понятно что Питон, просто может задача строчкой в матлабе решается и нахуй ебаться?


живое величие

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
(изменено)

для вычислений c++, фортран (для ебанутых стариков-дегенератов) или rust (с памятью приятно работать)

 

вроде есть ещё язык R если статистики дохуя но я хз чё за язык


Изменено пользователем E1azor

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:    всё что пишу -- шизофренический бред     :zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
(изменено)

Загуглил, вроде питон используется в моделировании + он популярный, ну походу популярнее чем С++. 

Вот пример, Родригез-Бенез и Пескин разработали модель для исследования теломер(когда клетка делится удваивается днк но при удваивании теряется часть информации с конца, обычно на концах находится теломеры которые укорачиваются, пока укорачиваются они проблем нету, когда начинают они заканчиватся начинаются проблемы всякие).

И вот челы написали модель. Модель была в состоянии предсказать распределение длины для теломеразо-положительных клеток, временную эволюцию длины теломер и продолжительность жизни клеточной линии

на основе уровней теломерного повторного связывания. Ну главное наверно это продолжительность жизни клеточной линии.

Это просто как пример в чем суть. Хз как они это сделали и как они это накодили и придумали. 

То есть я так понял они накодили модель клетки и поменяли в ней длину теломер воздейтсвием на них. Это году в 2010

Затем уже в 2019 на конференции говорилось что эксперементально увеличив длину теломер сумели увеличить продолжительность жизни мышей и они были более молодыми.


Изменено пользователем William Lee

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

Загуглил, вроде питон используется в моделировании + он популярный, ну походу популярнее чем С++. 

Вот пример, Родригез-Бенез и Пескин разработали модель для исследования теломер(когда клетка делится удваивается днк но при удваивании теряется часть информации с конца, обычно на концах находится теломеры которые укорачиваются, пока укорачиваются они проблем нету, когда начинают они заканчиватся начинаются проблемы всякие).

И вот челы написали модель. Модель была в состоянии предсказать распределение длины для теломеразо-положительных клеток, временную эволюцию длины теломер и продолжительность жизни клеточной линии

на основе уровней теломерного повторного связывания. Ну главное наверно это продолжительность жизни клеточной линии.

Это просто как пример в чем суть. Хз как они это сделали и как они это накодили и придумали.

Точно начни с питона если ты не особо разбираешься. У питона очень большое комьюнити в научных кругах и много вспомогательных инструментов уже сделано. Если в процессе увидишь, что чего-то не хватает, то уже тогда смотри на другие языки в зависимости от тех проблем что появятся.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

Начни зарабатывать уже сегодня

 

https://storage.googleapis.com/openscreenshot/B/D/J/Hk6h3FJDB.png


 

<< твой комментарий очень важен для форума.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
(изменено)

Начни зарабатывать уже сегодня

 

Hk6h3FJDB.png

Типо залить своё резюме, и при скачивании другим юзером, тебе 1$ падает?  :trollface:

 

 


Изменено пользователем Professor1

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

Загуглил, вроде питон используется в моделировании + он популярный, ну походу популярнее чем С++. 

Вот пример, Родригез-Бенез и Пескин разработали модель для исследования теломер(когда клетка делится удваивается днк но при удваивании теряется часть информации с конца, обычно на концах находится теломеры которые укорачиваются, пока укорачиваются они проблем нету, когда начинают они заканчиватся начинаются проблемы всякие).

И вот челы написали модель. Модель была в состоянии предсказать распределение длины для теломеразо-положительных клеток, временную эволюцию длины теломер и продолжительность жизни клеточной линии

на основе уровней теломерного повторного связывания. Ну главное наверно это продолжительность жизни клеточной линии.

Это просто как пример в чем суть. Хз как они это сделали и как они это накодили и придумали. 

То есть я так понял они накодили модель клетки и поменяли в ней длину теломер воздейтсвием на них. Это году в 2010

Затем уже в 2019 на конференции говорилось что эксперементально увеличив длину теломер сумели увеличить продолжительность жизни мышей и они были более молодыми.

кароче питон

вообще ты путаешь модель, алгоритм, и код

разнработать модель - это вообще к программированию не особо относится, это то что ты можешь на листочке описать в научной статье

конечно обычно в модель сразу придумывают как будут это просчитывать и тут уже есть алгоритм на псевдокоде который можно легко транслировтаь на любой нормальный язык


 

очень крутые котейки

RqvSzvr.png


Кому-то пизды дал - нужно сделать скрин обязательно. (с) Solo

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

 

 

псевдокоде который можно легко транслировтаь на любой нормальный язык

Реализовывать на произвольном языке - быть дауном

Например, если сильно числодробительная задача то языки высокого уровня не подходят


:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:    всё что пишу -- шизофренический бред     :zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
(изменено)

 

псевдокоде который можно легко транслировтаь на любой нормальный язык

Реализовывать на произвольном языке - быть дауном

Например, если сильно числодробительная задача то языки высокого уровня не подходят

 

в теории да.

на практике есть питон с либами типа пандас которые предоставляют интерфейсы числодробилок  которые низкоуровнево используют нативный код и производительность там выше если бы ты сам написал их на сях, потому что туда вложена тонна человекачасов и экспертизы

 

ну и

у человека выше как ты видишь не нужно стрим бигдаты обрабатывать. а просто просчитать обычную мат модель

более того есть спец инструменты типа матлаба или вольфрама для этого. для которых псевдокод будет гораздо лучше чем сишный заоптимизированный код

так что я с тобой сильно не согласен


Изменено пользователем Just.Doit

 

очень крутые котейки

RqvSzvr.png


Кому-то пизды дал - нужно сделать скрин обязательно. (с) Solo

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
(изменено)
питон с либами

в либы в с++ тоже вложены милиёны часов

 

разница всё равно будет охуительная между питоном и с++

 

если алгоритм более-менне сложный, то самая узкая часть будет занимать, скажем, 50% времени, всё остальное будет тормозиться питоном, предположим в 2 раза скорость упадёт и я буду жать решение не 1 неделю а 2 недели, нахуй надо


Изменено пользователем E1azor

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:    всё что пишу -- шизофренический бред     :zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

бля сори но ты тупой

`KV и E1azor понравилось это

 

очень крутые котейки

RqvSzvr.png


Кому-то пизды дал - нужно сделать скрин обязательно. (с) Solo

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

я занимаюсь числодробилками прямо сейчас


:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:    всё что пишу -- шизофренический бред     :zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

 

питон с либами

в либы в с++ тоже вложены милиёны часов

 

разница всё равно будет охуительная между питоном и с++

 

если алгоритм более-менне сложный, то самая узкая часть будет занимать, скажем, 50% времени, всё остальное будет тормозиться питоном, предположим в 2 раза скорость упадёт и я буду жать решение не 1 неделю а 2 недели, нахуй надо

 

не говорите ему что можно параллелить ))


 

<< твой комментарий очень важен для форума.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

 


у человека выше как ты видишь не нужно стрим бигдаты обрабатывать. а просто просчитать обычную мат модель

более того есть спец инструменты типа матлаба или вольфрама для этого. для которых псевдокод будет гораздо лучше чем сишный заоптимизированный код

так что я с тобой сильно не согласен

пока что не ясно какую

если производительность не нужна и проще всего на лету кбашить аналитику в коде то офк мэйпл или матиматика - топчик


 

 

не говорите ему что можно параллелить ))

спасибо не знал что все алгоритмы можно распараллелить


:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:    всё что пишу -- шизофренический бред     :zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
(изменено)

спасибо не знал что все алгоритмы можно распараллелить

спасибо не знал что не все алгоритмы можно параллелить.

 

Тыж нихуя не уточнил, лишь высрал своё важно и единственно верное мнение.  :nate:


Изменено пользователем SKYnv

 

<< твой комментарий очень важен для форума.

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

 

 

высрал своё важно и единственно верное мнение

Я высрал очевидные факты. Низкоуровневые языки быстрее высокоуровневых, поэтому если нужна скорость то выбор очевиден.


параллелить не параллелить всё равно твой питон сосёт за обе щёки какая разница


:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:    всё что пишу -- шизофренический бред     :zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

:zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu::zatrolka_tupostu:

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

но питон это ж си  honkler


:buba:

ни мало ни много, а много и мало

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение

тут без знания компиляторов не разобраться.


 

^работаю в стартапе без инвесторов, какие подводные камни?

Ну инвестиции у стартапа то все равно скорее всего есть, просто они от фаундеров, если конечно речь не работягах которые по фану запилили сайтик, начали генерировать тонны денег и позволили себе на эти деньги начать нанимать людей.

 

У тебя стоки есть? Или чисто зп?

 

в след месяце должны бумажки дать, но всякое может быть :) посмотрим, что будет.


Saying that Java is nice because it works on all OS's is like saying that anal sex is nice because it works on all genders.
 

Поделиться сообщением


Ссылка на сообщение
Гость
Эта тема закрыта для публикации сообщений.

×
×
  • Создать...